На факультете 5 кафедр, основные направления научной деятельности:

• изучение физико-географических, антропогенных и техногенных факторов формирования природной среды территории РК;
• закономерности развития эколого-геоморфологических процессов на территории Казахстана и их картографирование;
• картографирование неблагоприятных эколого-геоморфологических процессов межгорных впадин Юго-Восточного Казахстана;
• гидрология горных территорий Казахстана, гидрологические проблемы внутриконтинентальных котловин, трансграничные и гидроэкологические проблемы Республики Казахстан (оценка ресурсов и прогноз использования природных вод Казахстана в условиях антропогенно- и климатически обусловленных изменений);
• исследование закономерностей формирования и динамики активности опасных метеорологических явлений и процессов на территории республики Казахстан;
• исследование теоретических и практических проблем территориальной организации туризма Республики Казахстан;
• разработка научных основ обеспечения энергоэкологической безопасности РК, изучение опыта передовых университетов мира и предприятий в данной области;
• Разработка методологических основ ГИС технологий территориального анализа при создании адаптивно-ландшафтной системы земледелия Республики Казахстан.

Также, ведется активная деятельность по поиску и внедрению новых инновационных прорывных научных исследований в области географии, природопользования, геоэкологии, рекреационной географии и туризма, целью которого является коммерциализация НИОКР с привлечение инвесторов, как на внутреннем рынке, так и на внешнем, которое будет способствовать реализации отраслевых программ по индустриальному развитию секторов экономики. В настоящее время ведется работа по 4-ем инновационным направлениям:

1. Геоинформационное картографирование геосистем для принятия управленческих решений;
2. Экопарк КазНУ – новый объект туризма на карте Алматы;
3. Зеленый мост через поколения;
4. Региональный хаб ЮНЕСКО в области устойчивого развития в КазНУ имени аль-Фараби.