Одним из ключевых положений политического курса Главы государства с самых первых дней независимости стала забота о сохранении и развитии человеческого капитала. Уже в январе 1992 года был принят первый Закон Республики Казахстан «Об образовании», а в 2000 году – Указ Президента Республики Казахстан «О государственной программе «Образование». Также в январе 1992 года был принят Закон «О науке и государственной научно-технической политике Республики Казахстан», в 1993 году – Указ Президента Республики Казахстан «О мерах по совершенствованию организации науки и развитию научно-технического потенциала республики». Эта законодательная база обеспечила принципиально новые возможности для развития образования и науки.

С 1993 года Постановлением Президента Республики Казахстан обрел статус автономного самоуправляемого государственного вуза и стал называться Казахским государственным Национальным университетом. Были сделаны первые принципиальные шаги к внедрению международных требований подготовки кадров и созданию новой научно-инновационной инфраструктуры – переход к двухступенчатой системе подготовки «бакалавриат – магистратура» и создание в составе университета сети НИИ и технологического парка.