Центр открыт Представительством Европейской Комиссии в Республике Казахстан в 1998 г. с целью содействия и координации учебных и исследовательских проектов. Центр занимается предоставлением и распространением информации о деятельности Европейского Союза, его институтов и политике, проводимой государствами-членами ЕС в области европейской интеграции; проводит конференции, «круглые столы», семинары; содействует развитию исследований по европейской тематике; распространяет опыт организации международного сотрудничества и повышает квалификации персонала высших учебных заведений региона; проводит семинары, в т.ч. международные по вопросам участия в образовательных программах ЕС.

    Консультационная деятельность сотрудников ЕИЦ является одним из основных направлений их работы. Сотрудники Центра проводят консультации как по деятельности ЕС в целом, так и по вопросам, связанным со странами европейского континента, знакомят студентов с образовательными программа европейских вузов.

     Центр регулярно организует гостевые лекции профессоров европейских вузов и «посольские часы». Ежегодно Центр организует конкурсы научных работ среди студентов, посвященные знанию Европейского Союза, вопросам сотрудничества ЕС и Казахстана. С 2002 г. директором Центра является профессор Байзакова К.И.