История Центра иранских исследований восходит к 1989 году. В 1991 году открылся кафедра ирано-тюрсккой филологии, основанная профессором З.Л. Рустемовым. В 1993-1994 гг. Завудующим кафедрой стала д.и.н. Жаппасбаева Ж.М. (Тулебаева). С 1994 по 2008 гг. возглавил кафедру иранистики и индологии д.ф.н., профессор Утеген Кумисбаев. С 2008 года по 2011 гг. Возглавила кафедрой иранист Г.Т. Жумадилова.

12 октября 2012 года Культурное представительство Исламской Республики Иран и факультет востоковедения Казахского национального университета имени аль-Фараби подписали соглашение об открытии Центра Иранистики. Предмет этого соглашения - создание и оснащение Центра Иранистики при КазНУ, что позволит организовывать различные научные, культурные и образовательные мероприятия при поддержке Культурного представительства Посольства Исламской Республики Ирана. Кроме того, Центр Иранистики организует курсы повышение квалификации для преподавателей персидского языка и литературы и для студентов языковые курсы персидского языка.