Военная кафедра была образована в 1934 году с целью подготовки военно-обученного резерва для соединений и частей Красной Армии, что было обусловлено сложным внешнеполитическим положением государства в связи с нарастанием угрозы фашистского нападения и провокационными  действиями японских милитаристов на Дальнем Востоке.

По ускоренной программе велась подготовка охотников-разведчиков, радистов-операторов, мотоциклистов, горных стрелков, гранатометчиков, специалистов по рукопашному бою, лыжников. Готовясь встать на защиту своей Родины, студенты-юноши и девушки проявляли огромное упорство и стремление к овладению знаниями военного дела.

В 1941 году по просьбе командования легендарной 316 стрелковой дивизии генерала И. Панфилова, одной из первых вставшей на пути врага, военной кафедрой были подготовлены специалисты по защите от отравляющих веществ.

В послевоенный период учебно-воспитательная работа кафедры строилась с учетом боевого опыта и потребностей армии в высоко подготовленных специалистах. С 1965 года обучение студентов на кафедре проводилось по двум военно-учетным специальностям – мотострелковой и зенитной артиллерии, с 1970 года дополнительно введена военно-политическая специальность.

В соответствии с современными требованиями совершенствовалась учебно-материальная база, штатная структура, повышался качественный уровень преподавательского состава, кафедра оснащалась новейшими образцами техники и вооружения.

Много сил и энергии в совершенствовании качества преподавания и обучения студентов вложили начальники военной кафедры - участники Великой Отечественной войны: генерал-майор Мишнин К.Д., полковник Колодько В.Д., полковник Мукомелов Ю.Т., награжденный орденом «Красной Звезды» за успехи в подготовке студентов.

На этапе строительства и реформирования Вооруженных Сил Республики Казахстан обучение и воспитание студентов осуществлялось на трех циклах военной кафедры:

• тактической подготовки;
• общевоенной и военно-технической подготовки;
• противовоздушной обороны.

В соответствии с приказом Министра обороны Республики Казахстан от 12 декабря 1994 года вводится новая программа подготовки студентов по следующим военно-учетным специальностям:

• командир взвода зенитной ракетной (ракетно-артиллерийской) батареи мотострелкового (танкового) полка;
• командир мотострелкового взвода на БМП-2.

На основании приказа Министра обороны Республики Казахстан от 22 января 2010 года вводятся новые военно-учетные специальности:

• юрисконсультская работа;
• организация воспитательной и социально-правовой работы в мотострелковых подразделениях.

Военную подготовку организуют и проводят опытные преподаватели. С момента образования Вооруженных Сил Республики Казахстан проведена реорганизация всех учебных и служебных помещений кафедры, получены и освоены новые образцы вооружения и военной техники, усовершенствована методика преподавания и обучения студентов.